病毒组：微生物研究新热点

1、病毒组的处理与分析 宏基因组数据挖掘和病毒样粒子（VLPS）分离富集测序两种方式进行分析处理 病毒的分类：动物病毒、植物病毒、噬菌体、亚病毒（类病毒、拟病毒等） 人类肠道病毒基因组数据库（Human Gut Virome Database，GVD） 2、病毒的富集方法 1.样品预处理 2.基于过滤的VLP富集 TFF/FeCl③/PEG等方法 3.基于离心的VLP富 0 Comments

1、病毒组的处理与分析

宏基因组数据挖掘和病毒样粒子（VLPS）分离富集测序两种方式进行分析处理

病毒的分类：动物病毒、植物病毒、噬菌体、亚病毒（类病毒、拟病毒等）

人类肠道病毒基因组数据库（Human Gut Virome Database，GVD）

2、病毒的富集方法

1.样品预处理

2.基于过滤的VLP富集

TFF/FeCl③/PEG等方法

3.基于离心的VLP富集

差速离心与密度离心

3.病毒核酸的扩增与测序

常用的测序平台：Illumina、Ion torrent、Solid、454 Roche、PacBio、Oxford Nanpore

4、病毒宏基因组生物信息分析

步骤1、数据质量控制和过滤

       2、病毒基因组组装

       3、病毒分类鉴定

        4、病毒多样性分析及功能注释等

 

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